يتألف مجلس إدارة المؤسسة من وزير الزراعة رئيساً والمدير العام للمؤسسة نائباً للرئيس وعضوين حكومييّن يمثلان وزارة المالية ووزارة التخطيط، إضافة إلى خمسة أعضاء غير حكوميين يتم تعيينهم لمدة ثلاث سنوات بقرار من مجلس الوزراء .
 ويتولى مجلس الإدارة رسم السياسة العامة للمؤسسة وتحديد الأسس والقواعد المتعلقة بالإقراض ورسم الإطار العام للإجراءات التنظيمية والمالية التي يتطلبها العمل وانتظامه وسلامته في أجهزة المؤسسة المختلفة .

 
اعضاء مجلس الادارة: 

• معالي  المهندس خالد موسى الحنيفات  / وزير االزراعة / رئيس مجلس الادارة 
• عطوفة المهندس محمد البلاونه/ مدير عام المؤسسة / نائب رئيس المجلس
• عطوفة السيد مجدي الشريقي / ممثل وزارة المالية 
• عطوفة المهندس نصر الزعبي / ممثل وزارة التخطيط
• سعادة السيد عودة الرواشدة  
• سعادة المهندس خالد عبيدات
• سعادة السيد موسى الفاعور
• سعادة السيد انور محمد عفاش القطعان
• سعادة السيد عرفات المريات